Апробация микросателлитных маркеров для генотипирования различных видов дуба: Quercus robur L., Q. rubra L. и Q. mongolica Fisch.
DOI:
https://doi.org/10.52575/2658-3453-2021-3-3-298-304Ключевые слова:
дуб, Quercus, генотипирование, микросателлиты, SSR, паспортизация древесных растенийАннотация
В современном лесном хозяйстве широко применяется анализ генетического разнообразия на основе микросателлитных маркеров. Многие из разработанных для отдельных видов генетические маркеры в настоящее время ожидают проверки видовой специфичности. Целью данного исследования является апробация праймеров для микросателлитных участков на трех различных видах дуба (Quercus robur Linnaeus, 1753; Q. rubra Linnaeus, 1753; Q. mongolica Fischer ex Ledebour, 1850) для определения их специфичности. Исследование проводилось методом ПЦР-амплификации с применением SSR-маркеров. Протестировано шесть пар праймеров к микросателлитным локусам для видов рода Quercus (Q. robur и Q. petraea (Mattuschka) Lieblein, 1784), а также одна пара праймеров для рода Fagus (F. sylvatica Linnaeus, 1753 и F. orientalis Lipsky, 1898). Результат анализа показал, что представленный набор микросателлитных маркеров пригоден для генотипирования дуба черешчатого, красного и монгольского, а также позволяет выявлять межвидовые различия. Апробированные маркеры в дальнейшем могут применяться для генетической паспортизации представителей данных видов.
Библиографические ссылки
Баранов О.Ю., Пантелеев С.В., Гончарова Л.В., Спиридович Е.В., Тарасевич А.В. 2015. Молекулярно-генетическое изучение видового разнообразия лесных древесных растений (на примере ботанических коллекций родов Betula L. и Pinus L.). В кн.: Проблемы сохранения биологического разнообразия и использования биологических ресурсов. Материалы III международной конференции, посвященной 110-летию со дня рождения академика Н.В. Смольского (г. Минск, 7–9 октября 2015 г.). Минск: 255–258.
Гродецкая Т.А., Ржевский С.Г., Гусева О.Ю. 2020. Молекулярно-генетическая оценка селекционного материала дуба черешчатого для введения в культуру in vitro. В кн.: Организация и регуляция физиолого-биохимических процессов. Межрегиональный сборник научных работ. Воронеж, Воронежский государственный университет: 42–46.
Гусева О.Ю., Ржевский С.Г. 2021. Оптимизация методики выделения ДНК из листьев дуба. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология, 39 (S1-2): 24.
Демкович А.Е., Коршиков И.И., Макогон И.В. 2014. Полиморфизм дуба черешчатого (Quercus robur L.) на Донецком кряже по микросателлитным локусам. Фактори експериментальної еволюції організмів, 14: 17–21.
Календарь Р.Н., Глазко В.И. 2002. Типы молекулярно-генетических маркеров и их применение. Физиология и биохимия культурных растений, 34 (4): 279–296.
Малеев В.П., Соколов С.Я. (сост.). 1951. Род 6. Quercus – Дуб. В кн.: Деревья и кустарники СССР. Т. 2. Покрытосеменные. М.-Л., Наука: 422–493.
Машкина О.С., Федулова Т.П., Табацкая Т.М., Кондратьева А.М., Шабанова Е.А. 2016. Молекулярно-генетическая и цитогенетическая оценка перспективных гибридов и размноженных in vitro клонов тополя и осины. Вестник Воронежского государственного университета. Серия: Химия. Биология. Фармация, 2: 60–69.
Падутов В.Е., Баранов О.Ю., Каган Д.И., Ковалевич О.А, Острикова М.Я., Пантелеев С.В., Ивановская С.И., Кулагин Д.В. 2014. Применение молекулярно-генетических методов в лесном хозяйстве Беларуси. Сибирский лесной журнал, 4: 16–20.
Федорова А.И., Михеева М.А. 2008. Древесные растения г. Воронежа (биоразнообразие и устойчивость). Воронеж, Издательско-полиграфический центр Воронежского государственного университета: 23–25.
Федулова Т.П., Исаков Ю.Н., Корчагин О.М., Исаков И.Ю., Кондратьева А.М., Ржевский С.Г. 2017. Молекулярно-генетическая дифференциация генотипов березы на основе полиморфизма SSR-маркеров. Лесотехнический журнал, 7 (4): 6–16.
Barstow M. 2018. Quercus mongolica. The IUCN Red List of Threatened Species 2018: e.T194200A2303793. https://dx.doi.org/10.2305/IUCN.UK.2018-1.RLTS.T194200A2303793.en.
Dzialuk A., Chybicki I., Burczyk J. 2005. PCR multiplexing of nuclear microsatellite loci in Quercus species. Plant Molecular Biology Reporter, 23 (2): 121–128.
Gomez A., Lind J.F., Gailing O. 2001. SSR markers for Quercus suber tree identification and embryo analysis. Journal of Heredity, 92 (3): 292–295.
Kampfer S., Lexer Ch., Glossl J., Steikellner H. 1998. Characterization of (GA) n microsatellite loci from Quercus robur. Hereditas, 129 (183): 1–86.
Lind J.F., Gailing O. 2013. Genetic structure of Quercus rubra L. and Quercus ellipsoidalis E.J. Hill populations at gene-based EST-SSR and nuclear SSR markers. Tree genetics & genomes, 9 (3): 707–722.
Pastorelli R., Smulders M.J.M., Vanõt Westende W.P.C., Vosman B., Giannini R., Vettori C., Vendramin G.G. 2003. Characterization of microsatellite markers in Fagus sylvatica L. and Fagus orientalis Lipsky. Molecular Ecology Notes, 3 (1): 76–78.
Politov D.V., Belokon M.M., Y.S. Belokon Y.S., Polyakova T.A., Shatokhina A.V., Mudrik E.A., Azarova A.B., Filippov M.V., Shestibratov K.A. 2015. Application of microsatellite loci for molecular identification of elite genotypes, analysis of clonality and genetic diversity in aspen Populus tremula L. (Salicaceae). International journal of plant genomics 2015: 1–11.
Ueno S., Tsumura Y. 2008. Development of ten microsatellite markers for Quercus mongolica var. crispula by database mining. Conservation Genetics, 9 (4): 1083–1085.
Просмотров аннотации: 254
Поделиться
Опубликован
Как цитировать
Выпуск
Раздел
Copyright (c) 2021 Станислав Геннадьевич Ржевский, Анна Михайловна Кондратьева
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution» («Атрибуция») 4.0 Всемирная.
